jueves, abril 30, 2020 

Evolución COVID-19 (29-abril)

Fallecidos diarios por cada 100.000 habitantes (escala exponencial) ajustados por exceso de mortandad:
He ajustado las curvas según el exceso de mortandad del estudio que enlace el otro día (nytimes) Para los países europeos que faltaban (Italia y Alemania) he usado los z-score del sistema Euromomo que lamentablemente no da cifras desagregadas porque los participantes no lo permiten (aunque España, por ejemplo, tiene su propia página donde sí informa, quizá lo hagan otros)

Para China (Hubei) he usado un artículo que habla de varios estudios que dicen que los muertos pueden ser 10 veces los publicados. Curiosamente on ese ajuste la curva llega a cifras por cada 100.000 habitantes muy similares a las de Europa (ojo, la web es Radio Free Asia y no cita fuentes pero las cifras de china tampoco son muy creíbles, la verdad)

No he ajustado los totales de muertos por dos razones: por un lado para no perder el hilo de lo que ya llevaba calculado y por otro porque algunos países (como España en Cataluña o Madrid) empiezan a cambiar el criterio de notificación acercándose a lo que hacen países como Bélgica que se desvía por encima de las muertes en exceso (lo que es lógico ya que tiene que haber menos muertes por otros conceptos como tráfico o accidentes laborales) y si aplico el factor directamente estaría sobrecalculando la cifra. La única forma sería disponer de este estudio cada cierto tiempo y reajustar pero es complicado de encontrar.

Como veréis las cifras no varían significativamente salvo Suecia que mejora mucho respecto al dato anterior: es porque también he cambiado la regresión lineal para usar los últimos 14 días en lugar de 7 porque algunos países -como Suecia- seguían produciendo mucho ruido y ya hay datos suficientes para alargar la muestra.
País Total a 31/7 % sobre población Diario a 31/7
Belgium 8.845 0,08% 0
France 27.030 0,04% 0
Italy 36.050 0,06% 6
Germany 9.720 0,01% 1
Netherlands 6.729 0,04% 1
Spain 29.003 0,06% 1
Sweden 6.142 0,06% 5
United Kingdom 32.064 0,05% 2
US 92.343 0,03% 9
China 3.266 0,01% 0

Por cierto, si miráis los datos de Suecia en los posts anteriores, además de ver cómo va saltando entre 0,03% y 0,14% (ahora está en 0,06%, más acorde con el resto) veréis que en los primeros posts no era Suecia sino Suiza. Cambié de Suiza a Suecia porque la  primera tenía más muertos al principio pero luego me pareció más interesante por su atrevida estrategia  y, efectivamente, el 17/4 superó a Suiza.



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domingo, abril 26, 2020 

Evolución COVID-19 (25-abril)

Fallecidos diarios por cada 100.000 habitantes (escala exponencial):
He puesto el gráfico en escala exponencial porque se ven más claras las cifras pequeñas al inicio y al final de la curva.
En la línea de 0,02 muertes por 100.000 coinciden con bastante exactitud los momentos en que cada país implantó las medidas más restrictivas (cierre de colegios y después cuarentena) con alguna excepción, pero no muy alejada.
Y casualmente, o no, en la de 0,2 muertes (10 veces más) empiezan a relajar o a anunciar relajaciones de las medidas. El más pronto ha sido Alemania, España ya anuncia para mediados de mayo e Italia dice que va a tardar (su curva va más lenta)
Todo esto con la excepción de Suecia que afrontó las cosas de otra forma y que como se ve tiene una curva lenta y muy elevada.
Ojo, Suecia, con Bélgica, son los dos países dentro de los estudiados (nytimes) que notifican bien las muertes por COVID19 -no tienen apenas diferencias con las totales por encima de las esperadas- mientras que el resto tenemos entre un 40% y un 50% más de exceso de muertes registradas que las notificadas por COVID19:
Si subiéramos un 40% a España y Reino Unido, un 50% a Francia y Holanda y demás, estarían todos los países mucho más juntos a Bélgica... excepto Suecia, que se mantendría como está. De momento parece que su estrategia funciona -al menos para su estilo de vida- pero el total final no les augura nada bueno si todo va como hasta ahora. En las cifras de total de muertes a 31/7, Suecia aún mantendría sobre 60 muertes diarias (en resto menos de 10):
País Total a 31/7 % sobre población Diario a 31/7
Belgium 8.643 0,08% 0
France 27.752 0,04% 0
Italy 37.349 0,06% 9
Germany 11.049 0,01% 2
Netherlands 7.710 0,04% 3
Spain 27.516 0,06% 1
Sweden 14.435 0,14% 59
United Kingdom 28.793 0,04% 1
US 100.415 0,03% 6
China 3.247 0,01% 0

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miércoles, abril 22, 2020 

Evolución COVID-19 (21-abril)

Fallecidos diarios por cada 100.000 habitantes:
 He suavizado la curva para que se vea mejor y también porque ya no estoy tomando la historia de Italia pues cada país tiene ya suficientes datos para evolucionar su ratio por separado. Pero hay países con mucha volatilidad en los datos de un día para otro y hay que hacer una media móvil para que salga algo razonable.

He aumentado al día 12 de junio el cálculo de fallecidos totales para que EE.UU. pueda terminar de aplanar la curva ya que va muy retrasado respecto al resto.

Estos son los datos. En EE.UU. ya salen las cifras que leo en la prensa. Con el debido cuidado que ya sabemos que hay que tener por cómo mide cada país los fallecidos, sigue siendo increíble la evolución de Suecia para las medidas que está tomando. No obstante aunque 3.700 parezcan pocas víctimas ahora que nois hemos "acostumbrado" a cifras muy superiores, medio en % de población se acerca a las cifras del resto. Veremos si Alemania mantiene el porcentaje tan bajo cuando los cálculos se hagan con el total de fallecidos sobre lo habitual en cada país. Entonces veremos realmente las cifras de la crisis del coronavirus, tanto de las muertes que habrá provocado y no se habrán contado, como las que habrá ahorrado por la situación sobre todo en tráfico y accidentes laborales.

País Total a 12/6 % sobre población
Belgium 9.785 0,09%
France 28.025 0,04%
Italy 37.703 0,06%
Germany 9.809 0,01%
Netherlands 5.841 0,03%
Spain 25.688 0,05%
Sweden 3.700 0,04%
United Kingdom 25.999 0,04%
US 172.543 0,05%
China 3.215 0,01%

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sábado, abril 18, 2020 

Evolución COVID-19 (17-abril)

Fallecidos diarios por cada 100.000 habitantes:
 
País Total a 29/5 % sobre población
Belgium 10.343 0,09%
France 31.961 0,05%
Italy 35.672 0,06%
Germany 7.873 0,01%
Netherlands 5.322 0,03%
Spain 28.975 0,06%
Sweden 2.614 0,03%
United Kingdom 28.392 0,04%
US 98.467 0,03%
China 3.265 0,01%

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martes, abril 14, 2020 

Evolución COVID-19 (13-abril)

Fallecidos diarios por cada 100.000 habitantes:

 
País Total a 29/5 % sobre población
Belgium 11.277 0,10 %
France 26.885 0,04 %
Italy 27.537 0,05 %
Germany 6.255 0,01 %
Netherlands 4.533 0,03 %
Spain 24.624 0,05 %
Sweden 2.187 0,02 %
United Kingdom 26.562 0,04 %
US 56.821 0,02 %
China 3.251 0,01 %

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viernes, abril 10, 2020 

Evolución COVID-19 (9-abril)

Fallecidos diarios por cada 100.000 habitantes:


País Total a 29/5 % sobre población
Belgium 7.887 0,07 %
France 27.551 0,04 %
Italy 23.181 0,04 %
Germany 7.407 0,01 %
Netherlands 4.689 0,03 %
Spain 22.639 0,05 %
Switzerland 1.900 0,02 %
United Kingdom 24.344 0,04 %
US 48.195 0,01 %
China 3.153 0,01 %

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martes, abril 07, 2020 

Evolución COVID-19 (6-abril)

Actualizo el gráfico de fallecidos diarios por cada 100.000 habitantes:
He arreglado la proyección porque tenía un error, ahora la curva no varía abruptamente salvo en algunos casos (los números de Francia varían mucho)




Y esta es la previsión a varias semanas que también mejora bastante al arreglar la proyección:
País Total a 29/5 % sobre población
Belgium 7.592 0,07 %
France 28.082 0,04 %
Italy 22.421 0,04 %
Germany 7.045 0,01 %
Netherlands 4.853 0,03 %
Spain 23.116 0,05 %
Switzerland 2.072 0,02 %
United Kingdom 27.253 0,04 %
US 47.181 0,01 %
China 3.115 0,01 %



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domingo, abril 05, 2020 

Evolución COVID-19 (4-abril)

Estoy siguiendo la evolución de la COVID-19 a través de los datos de esta página: https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19/blob/master/csse_covid_19_data/csse_covid_19_time_series/time_series_covid19_deaths_global.csv

Son los fallecidos porque es el  dato más homogéneo aunque también haya diferencias entre la forma de medirlos en cada país.

Nota: el dato de China es el de Hubei y está desplazado más de un mes hacia delante para que cupiera bien.

A partir del último día con datos (4/4) he realizado una proyección basándome en la evolución de los días para duplicar los fallecidos de la seria de Italia (excepto China que tiene sus propios datos) y extrapolando a partir de ahí. No queda bien extrapolar en cada país sus propios datos porque la curva es más que exponencial (realmente tiene asíntota porque los días para duplicar tienen a infinito) y no he querido usar China como base porque no me fío de los datos y también por tener un control.


Fallecidos:
Los saltos que dan las series son o bien porque en los días iniciales las cifras son menos significativas (no hay "medio muerto") o bien en algunos países que da la sensación de que los fines de semana cuenta de menos y luego ajustan. Es otro motivo por el que para la proyección he usado a Italia, porque además de tener más tramo recorrido sus datos son bastante homogéneos (junto con los de España, por cierto).


Días para duplicar los fallecidos:
Se ve como cada país ha empezado a tener el brote o a mitigarlo en fechas distintas. El caso más claro es España respecto a Italia que les separa una semana más o menos de forma muy similar.

Fallecidos con inicio a los 100:
Para comparar mejor unos países con otros los he desplazados a un origen común el día que pasan la barrera de los 100 muertos. Se aprecia cómo unos países aceleraron más al inicio de brote que otros (España el que más) lo que les produce una pendiente mayor a mitigar. No obstante también hay diferencias en la efectividad de las medidas a partir del día 100; España, por ejemplo, corrige muy rápido su mala tendencia inicial; se ve mejor en el siguiente gráfico.


Días para duplicar con inicio a los 100:
Al desplazar todos los países a un inicio común se aprecia mejor cómo ha sido la evolución de cada uno, que dependerá de cómo haya sido el brote inicial (no es lo mismo comenzar en una ciudad que en cinco), de la movilidad y distancia social de cada población (peor en ciudades con más transporte público), de la rapidez en tomar medidas y de la efectividad de las mismas.
Como he proyectado todos (excepto China) con la curva de Italia salen paralelas, pero distanciadas en el eje vertical según el punto en que esté cada una cuando comienzo a proyectar. Esta técnica tiene varios inconvenientes pero comparando con China (que está sin tocar) no tiene mala pinta.

Fallecidos diarios por cada 100.000 habitantes:
Estas son las curvas de fallecidos diarios (por cada 100.000 habitantes) que serán seguramente las que dicten el momento de relajar las medidas. Hay demasiados datos o no se aprecia bien pero en el caso de España se ven dos cosas: una, que proyecta para el día 5 de abril muchos más muertos que el día 4 que parecía que se corregía. Esto es porque la proyección la hago con la media semanal del logarítmo de la duplicación (de Italia) para suavizar la curva. En este instante Italia tiene un "bote" semanal que hace que casi todos los países "pierdan" fuelle respecto al día 4/4. Esto se arreglará en los días siguientes pero también ocurrirá lo contrario (mejorará más de lo normal). La segunda cosa que se aprecia en España es que, si consideramos como punto de partida el 13/3, llegaremos a una situación similar en fallecidos diarios sobre el 6 de mayo o un poco antes si la mejora del 4 de abril es real.

Otra cosa que se aprecia, al calcular el dato por cada 100.000 habitantes, es el impacto a nivel nacional en cada país. Al tratarse de brotes fundamentalmente urbanos, la evolución inicial en números absolutos es parecida en todos los países aunque unos tengan más población que otros. La propagación posterior ya iguala un poco las cosas pues en países con más población hay más opciones de propagación y contagio finalmente. Llaman la atención los números de Bélgica; para asegurarme de que no era un producto espúreo de los cálculos he comparado los datos reales con los de Italia (a los mismos días de los 100 fallecidos) y efectivamente llevan más proporción respecto a su población. Sin embargo, aunque Suiza tiene una población equivalente (son los dos más pequeños pintados) tiene mejor evolución.

La otra cosa que se aprecia, pero en este sí tiene una causa razonable, es el pero de dato del Reino Unido. La semana perdida le hace incrementar la cifra pero seguramente esto no será así finalmente. Los fallecidos ya acaecidos ya no se van a poder solucionar y eso le aúpa en el gráfico, pero el grueso está por llegar y serán las medidas actuales y posteriores las que marquen el pico de fallecidos. Por ejemplo, comparando España con Italia se ve que España lo está haciendo un poco mejor la última semana que la equivalente de Italia (la anterior a esta última)

Por último los datos de fallecidos totales según la proyección a 29/5:

País Total a 29/5 % sobre población
Belgium 13.814 0,13 %
France 50.350 0,08 %
Italy 25.455 0,04 %
Germany 12.877 0,02 %
Netherlands 8.974 0,05 %
Spain 33.924 0,07 %
Switzerland 3.577 0,04 %
United Kingdom 52.865 0,08 %
US 89.241 0,03 %
China 3.169 0,01 %

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